Отключване на силата на прага на масспектрометрията (MS-Th) в изследването на протеомиката

MS-TH означава "масова спектрометрия - праг".

В масспектрометрията праговата енергия (или праг) се отнася до минималното количество енергия, необходимо за йонизиране на молекула и производство на йони, които могат да бъдат открити от масспектрометъра. Праговата енергия обикновено се определя от настройките на инструмента и може да варира в зависимост от вида на инструмента и пробата, която се анализира.

В контекста на MS-Th, това е техника, използвана за подобряване на чувствителността и точността на базираната на масова спектрометрия протеомика експерименти. Основната идея зад MS-Th е да се използва по-ниска прагова енергия за откриване на по-изобилни пептиди, докато се използва по-висок прагова енергия за откриване на по-малко изобилни пептиди. Това позволява отделянето на най-изобилните пептиди от по-малко изобилните, което може да подобри общото качество на данните и да улесни идентифицирането на протеини в сложни смеси.

MS-Th обикновено се постига чрез използване на комбинация от настройки на инструмента, като регулиране на параметрите на източника на йони, параметрите на масовия анализатор и усилването на детектора, за оптимизиране на откриването на различни пептидни популации. Конкретните използвани настройки ще зависят от експеримента и целите на анализа, но общата идея е да се използва по-ниска прагова енергия за най-изобилните пептиди и по-висока прагова енергия за по-малко изобилните.