ProAl: Eine leistungsstarke Software zur Vorhersage der Proteinstruktur

ProAl ist eine Software zur Vorhersage der Proteinstruktur, die eine Kombination aus maschinellen Lernalgorithmen und strukturellen Bioinformatik-Tools verwendet, um die dreidimensionale Struktur von Proteinen anhand ihrer Aminosäuresequenz vorherzusagen. Es wurde von der University of California, San Diego, entwickelt und wird häufig auf dem Gebiet der Proteinstrukturvorhersage eingesetzt.

ProAl verwendet einen zweistufigen Ansatz zur Proteinstrukturvorhersage. In der ersten Stufe wird ein maschineller Lernalgorithmus namens „profilbasiert“ verwendet, um die Sekundärstruktur (d. h. die lokalen Anordnungen der Aminosäuren) des Proteins vorherzusagen. In der zweiten Stufe wird ein anderer maschineller Lernalgorithmus namens „template-based“ verwendet, um die Tertiärstruktur (d. h. die gesamte 3D-Form) des Proteins basierend auf der vorhergesagten Sekundärstruktur vorherzusagen.

ProAl kann verwendet werden, um die Strukturen von vorherzusagen Sowohl lösliche als auch Membranproteine, und es wurde auf eine Vielzahl von Proteinsystemen angewendet, darunter Enzyme, Rezeptoren und virale Proteine. Es ist ein nützliches Werkzeug für Forscher, die die Funktion und Dynamik von Proteinen untersuchen, sowie für die Entdeckung und Entwicklung von Arzneimitteln.