ProAl: un potente software de predicción de la estructura de las proteínas

ProAl es un software de predicción de la estructura de proteínas que utiliza una combinación de algoritmos de aprendizaje automático y herramientas de bioinformática estructural para predecir la estructura tridimensional de las proteínas a partir de su secuencia de aminoácidos. Fue desarrollado por la Universidad de California en San Diego y se utiliza ampliamente en el campo de la predicción de la estructura de las proteínas.

ProAl utiliza un enfoque de dos etapas para la predicción de la estructura de las proteínas. En la primera etapa, utiliza un algoritmo de aprendizaje automático llamado "basado en perfiles" para predecir la estructura secundaria (es decir, las disposiciones locales de los aminoácidos) de la proteína. En la segunda etapa, utiliza un algoritmo de aprendizaje automático diferente llamado "basado en plantilla" para predecir la estructura terciaria (es decir, la forma 3D general) de la proteína en función de la estructura secundaria predicha.

ProAl se puede utilizar para predecir las estructuras de proteínas tanto solubles como de membrana, y se ha aplicado a una amplia gama de sistemas proteicos, incluidos enzimas, receptores y proteínas virales. Es una herramienta útil para los investigadores que estudian la función y la dinámica de las proteínas, así como para el descubrimiento y desarrollo de fármacos.