प्रोएएल: एक शक्तिशाली प्रोटीन संरचना भविष्यवाणी सॉफ्टवेयर
ProAl एक प्रोटीन संरचना भविष्यवाणी सॉफ्टवेयर है जो अपने अमीनो एसिड अनुक्रम से प्रोटीन की त्रि-आयामी संरचना की भविष्यवाणी करने के लिए मशीन लर्निंग एल्गोरिदम और संरचनात्मक जैव सूचना विज्ञान उपकरणों के संयोजन का उपयोग करता है। इसे कैलिफोर्निया विश्वविद्यालय, सैन डिएगो द्वारा विकसित किया गया था और प्रोटीन संरचना भविष्यवाणी के क्षेत्र में इसका व्यापक रूप से उपयोग किया जाता है। ProAl प्रोटीन संरचना भविष्यवाणी के लिए दो-चरणीय दृष्टिकोण का उपयोग करता है। पहले चरण में, यह प्रोटीन की द्वितीयक संरचना (यानी, अमीनो एसिड की स्थानीय व्यवस्था) की भविष्यवाणी करने के लिए "प्रोफाइल-आधारित" नामक मशीन लर्निंग एल्गोरिदम का उपयोग करता है। दूसरे चरण में, यह अनुमानित माध्यमिक संरचना के आधार पर प्रोटीन की तृतीयक संरचना (यानी, समग्र 3 डी आकार) की भविष्यवाणी करने के लिए "टेम्पलेट-आधारित" नामक एक अलग मशीन लर्निंग एल्गोरिदम का उपयोग करता है। ProAl का उपयोग संरचनाओं की भविष्यवाणी करने के लिए किया जा सकता है। घुलनशील और झिल्लीदार प्रोटीन दोनों, और इसे एंजाइम, रिसेप्टर्स और वायरल प्रोटीन सहित प्रोटीन प्रणालियों की एक विस्तृत श्रृंखला पर लागू किया गया है। यह प्रोटीन फ़ंक्शन और गतिशीलता का अध्ययन करने वाले शोधकर्ताओं के साथ-साथ दवा की खोज और विकास के लिए एक उपयोगी उपकरण है।
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