A tömegspektrometria-küszöb (MS-Th) erejének felszabadítása a proteomikai kutatásban

Az MS-TH a „tömegspektrometria – küszöb” rövidítése. A tömegspektrometriában a küszöbenergia (vagy küszöb) a molekula ionizálásához és a tömegspektrométerrel kimutatható ionok előállításához szükséges minimális energiamennyiségre utal. A küszöbenergiát jellemzően a műszer beállításai határozzák meg, és a műszer típusától és az elemzett mintától függően változhat.

Az MS-Th összefüggésében ez egy olyan technika, amelyet a tömegspektrometrián alapuló proteomika érzékenységének és pontosságának javítására használnak. kísérletek. Az MS-Th mögött meghúzódó alapötlet az, hogy alacsonyabb küszöbenergiát használjunk nagyobb mennyiségben előforduló peptidek kimutatására, míg magasabb küszöbenergiát a kevésbé bőséges peptidek kimutatására. Ez lehetővé teszi a legnagyobb mennyiségben előforduló peptidek elkülönítését a kevésbé előforduló peptidektől, ami javíthatja az adatok általános minőségét, és megkönnyíti a fehérjék azonosítását összetett keverékekben.

MS-Th jellemzően a műszerbeállítások kombinációjával érhető el, például az ionforrás paramétereinek, a tömegelemző paramétereinek és a detektor erősítésének beállítása a különböző peptidpopulációk kimutatásának optimalizálása érdekében. Az alkalmazott konkrét beállítások a kísérlettől és az elemzés céljaitól függenek, de az általános elképzelés az, hogy a legnagyobb mennyiségben előforduló peptidekhez alacsonyabb küszöbenergiát, a kevésbé bőséges peptidekhez pedig magasabb küszöbenergiát kell használni.