Membuka Kekuatan Ambang Spektrometri Massa (MS-Th) dalam Penelitian Proteomik

MS-TH adalah singkatan dari "Mass Spectrometry - Threshold".

Dalam spektrometri massa, energi ambang batas (atau ambang batas) mengacu pada jumlah energi minimum yang diperlukan untuk mengionisasi suatu molekul dan menghasilkan ion yang dapat dideteksi oleh spektrometer massa. Energi ambang batas biasanya ditentukan oleh pengaturan instrumen dan dapat bervariasi tergantung pada jenis instrumen dan sampel yang dianalisis.

Dalam konteks MS-Th, ini adalah teknik yang digunakan untuk meningkatkan sensitivitas dan akurasi proteomik berbasis spektrometri massa eksperimen. Ide dasar di balik MS-Th adalah menggunakan energi ambang batas yang lebih rendah untuk mendeteksi peptida yang lebih melimpah, sementara menggunakan energi ambang batas yang lebih tinggi untuk mendeteksi peptida yang berlimpah lebih sedikit. Hal ini memungkinkan pemisahan peptida yang paling melimpah dari peptida yang kurang melimpah, sehingga dapat meningkatkan kualitas data secara keseluruhan dan mempermudah identifikasi protein dalam campuran kompleks.

MS-Th biasanya dicapai dengan menggunakan kombinasi pengaturan instrumen, seperti menyesuaikan parameter sumber ion, parameter penganalisis massa, dan penguatan detektor, untuk mengoptimalkan deteksi populasi peptida yang berbeda. Pengaturan spesifik yang digunakan akan bergantung pada eksperimen dan tujuan analisis, namun ide umumnya adalah menggunakan energi ambang batas yang lebih rendah untuk peptida yang paling berlimpah dan energi ambang batas yang lebih tinggi untuk peptida yang kurang melimpah.