ProAl: Perangkat Lunak Prediksi Struktur Protein yang Kuat

ProAl adalah perangkat lunak prediksi struktur protein yang menggunakan kombinasi algoritma pembelajaran mesin dan alat bioinformatika struktural untuk memprediksi struktur tiga dimensi protein dari urutan asam aminonya. Ini dikembangkan oleh Universitas California, San Diego dan banyak digunakan dalam bidang prediksi struktur protein.

ProAl menggunakan pendekatan dua tahap untuk prediksi struktur protein. Pada tahap pertama, ia menggunakan algoritme pembelajaran mesin yang disebut "berbasis profil" untuk memprediksi struktur sekunder (yaitu susunan lokal asam amino) protein. Pada tahap kedua, ia menggunakan algoritme pembelajaran mesin berbeda yang disebut "berbasis templat" untuk memprediksi struktur tersier (yaitu, keseluruhan bentuk 3D) protein berdasarkan prediksi struktur sekunder.

ProAl dapat digunakan untuk memprediksi struktur baik protein larut maupun membran, dan telah diterapkan pada berbagai sistem protein, termasuk enzim, reseptor, dan protein virus. Ini adalah alat yang berguna bagi para peneliti yang mempelajari fungsi dan dinamika protein, serta untuk penemuan dan pengembangan obat.