ProAl: 強力なタンパク質構造予測ソフトウェア

ProAl は、機械学習アルゴリズムと構造バイオインフォマティクスツールを組み合わせて使用し、アミノ酸配列からタンパク質の三次元構造を予測するタンパク質構造予測ソフトウェアです。これはカリフォルニア大学サンディエゴ校によって開発され、タンパク質構造予測の分野で広く使用されています。

ProAl はタンパク質構造予測に 2 段階のアプローチを使用します。第 1 段階では、「プロファイルベース」と呼ばれる機械学習アルゴリズムを使用して、タンパク質の二次構造 (つまり、アミノ酸の局所的な配置) を予測します。第 2 段階では、「テンプレートベース」と呼ばれる別の機械学習アルゴリズムを使用して、予測された二次構造に基づいてタンパク質の三次構造 (つまり、全体的な 3D 形状) を予測します。

ProAl を使用して、タンパク質の構造を予測できます。可溶性タンパク質と膜タンパク質の両方に適用されており、酵素、受容体、ウイルスタンパク質などの幅広いタンパク質システムに適用されています。これは、タンパク質の機能と動態を研究する研究者、および創薬と開発にとって有用なツールです。