ProAl: Perisian Ramalan Struktur Protein Berkuasa

ProAl ialah perisian ramalan struktur protein yang menggunakan gabungan algoritma pembelajaran mesin dan alat bioinformatik struktur untuk meramalkan struktur tiga dimensi protein daripada jujukan asid aminonya. Ia dibangunkan oleh Universiti California, San Diego dan digunakan secara meluas dalam bidang ramalan struktur protein.

ProAl menggunakan pendekatan dua peringkat untuk ramalan struktur protein. Pada peringkat pertama, ia menggunakan algoritma pembelajaran mesin yang dipanggil "berasaskan profil" untuk meramalkan struktur sekunder (iaitu, susunan tempatan asid amino) protein. Pada peringkat kedua, ia menggunakan algoritma pembelajaran mesin yang berbeza yang dipanggil "berasaskan templat" untuk meramalkan struktur tertiari (iaitu, bentuk 3D keseluruhan) protein berdasarkan struktur sekunder yang diramalkan.

ProAl boleh digunakan untuk meramalkan struktur kedua-dua protein larut dan membran, dan ia telah digunakan pada pelbagai sistem protein, termasuk enzim, reseptor, dan protein virus. Ia adalah alat yang berguna untuk penyelidik yang mengkaji fungsi dan dinamik protein, serta untuk penemuan dan pembangunan ubat.