Ontsluiten van de kracht van massaspectrometrie-drempel (MS-Th) in Proteomics-onderzoek

MS-TH staat voor "Mass Spectrometry - Threshold". Bij massaspectrometrie verwijst de drempelenergie (of drempel) naar de minimale hoeveelheid energie die nodig is om een molecuul te ioniseren en ionen te produceren die door de massaspectrometer kunnen worden gedetecteerd. De drempelenergie wordt doorgaans bepaald door de instellingen van het instrument en kan variëren afhankelijk van het type instrument en het monster dat wordt geanalyseerd.

In de context van MS-Th is het een techniek die wordt gebruikt om de gevoeligheid en nauwkeurigheid van op massaspectrometrie gebaseerde proteomics te verbeteren experimenten. Het basisidee achter MS-Th is om een lagere drempelenergie te gebruiken om meer overvloedige peptiden te detecteren, terwijl een hogere drempelenergie wordt gebruikt om minder overvloedige peptiden te detecteren. Dit maakt de scheiding mogelijk van de meest voorkomende peptiden van de minder overvloedige, wat de algehele kwaliteit van de gegevens kan verbeteren en het gemakkelijker kan maken om eiwitten in complexe mengsels te identificeren. MS-Th wordt doorgaans bereikt door een combinatie van instrumentinstellingen te gebruiken, zoals het aanpassen van de ionenbronparameters, de massa-analysatorparameters en de detectorversterking, om de detectie van verschillende peptidepopulaties te optimaliseren. De specifieke gebruikte instellingen zullen afhangen van het experiment en de doelstellingen van de analyse, maar het algemene idee is om een lagere drempelenergie te gebruiken voor de meest voorkomende peptiden en een hogere drempelenergie voor de minder overvloedige.