Låse opp kraften til massespektrometri-terskel (MS-Th) i proteomikkforskning

MS-TH står for "Mass Spectrometry - Threshold".

I massespektrometri refererer terskelenergien (eller terskelen) til minimumsmengden energi som kreves for å ionisere et molekyl og produsere ioner som kan detekteres av massespektrometeret. Terskelenergien bestemmes typisk av instrumentets innstillinger og kan variere avhengig av typen instrument og prøven som analyseres.

I sammenheng med MS-Th er det en teknikk som brukes for å forbedre følsomheten og nøyaktigheten til massespektrometribasert proteomikk eksperimenter. Den grunnleggende ideen bak MS-Th er å bruke en lavere terskelenergi for å oppdage mer rikelig med peptider mens du bruker en høyere terskelenergi for å oppdage mindre rikelig med peptider. Dette gjør det mulig å separere de mest rike peptidene fra de mindre rikelig, noe som kan forbedre den generelle kvaliteten på dataene og gjøre det lettere å identifisere proteiner i komplekse blandinger.

MS-Th oppnås vanligvis ved å bruke en kombinasjon av instrumentinnstillinger, som å justere ionekildeparametrene, masseanalysatorparametrene og detektorforsterkningen, for å optimalisere deteksjonen av forskjellige peptidpopulasjoner. De spesifikke innstillingene som brukes vil avhenge av eksperimentet og målene for analysen, men den generelle ideen er å bruke en lavere terskelenergi for de mest tallrike peptidene og en høyere terskelenergi for de mindre rikelig.