Odblokowanie mocy progu spektrometrii mas (MS-Th) w badaniach proteomicznych

MS-TH oznacza „Spektrometria mas – próg”. W spektrometrii mas energia progowa (lub próg) odnosi się do minimalnej ilości energii wymaganej do jonizacji cząsteczki i wytworzenia jonów, które można wykryć za pomocą spektrometru mas. Energia progowa jest zwykle określana na podstawie ustawień instrumentu i może się różnić w zależności od rodzaju instrumentu i analizowanej próbki.

W kontekście MS-Th jest to technika stosowana w celu poprawy czułości i dokładności proteomiki opartej na spektrometrii mas eksperymenty. Podstawową ideą MS-Th jest wykorzystanie niższej energii progowej do wykrywania peptydów występujących w większej liczbie, przy jednoczesnym wykorzystaniu wyższej energii progowej do wykrywania peptydów występujących w mniejszej liczbie. Pozwala to na oddzielenie peptydów występujących najczęściej od peptydów mniej występujących, co może poprawić ogólną jakość danych i ułatwić identyfikację białek w złożonych mieszaninach.

MS-Th zazwyczaj osiąga się poprzez zastosowanie kombinacji ustawień instrumentu, takie jak dostosowanie parametrów źródła jonów, parametrów analizatora mas i wzmocnienia detektora, w celu optymalizacji wykrywania różnych populacji peptydów. Konkretne zastosowane ustawienia będą zależeć od eksperymentu i celów analizy, ale ogólna koncepcja polega na zastosowaniu niższej energii progowej dla peptydów występujących w największej liczbie i wyższej energii progowej dla peptydów mniej występujących.