ProAl: um poderoso software de previsão de estrutura de proteínas

ProAl é um software de previsão de estrutura de proteínas que usa uma combinação de algoritmos de aprendizado de máquina e ferramentas de bioinformática estrutural para prever a estrutura tridimensional de proteínas a partir de sua sequência de aminoácidos. Foi desenvolvido pela Universidade da Califórnia, San Diego e é amplamente utilizado no campo da previsão da estrutura de proteínas.

ProAl usa uma abordagem de dois estágios para a previsão da estrutura de proteínas. Na primeira etapa, utiliza um algoritmo de aprendizado de máquina denominado “baseado em perfil” para prever a estrutura secundária (ou seja, os arranjos locais de aminoácidos) da proteína. No segundo estágio, ele usa um algoritmo de aprendizado de máquina diferente chamado "baseado em modelo" para prever a estrutura terciária (ou seja, a forma 3D geral) da proteína com base na estrutura secundária prevista.

ProAl pode ser usado para prever as estruturas de proteínas solúveis e de membrana, e tem sido aplicado a uma ampla gama de sistemas proteicos, incluindo enzimas, receptores e proteínas virais. É uma ferramenta útil para pesquisadores que estudam a função e a dinâmica das proteínas, bem como para a descoberta e desenvolvimento de medicamentos.