ProAl: Un software puternic de predicție a structurii proteinelor

ProAl este un software de predicție a structurii proteinelor care utilizează o combinație de algoritmi de învățare automată și instrumente de bioinformatică structurală pentru a prezice structura tridimensională a proteinelor din secvența lor de aminoacizi. A fost dezvoltat de Universitatea din California, San Diego și este utilizat pe scară largă în domeniul predicției structurii proteinelor.

ProAl folosește o abordare în două etape a predicției structurii proteinelor. În prima etapă, folosește un algoritm de învățare automată numit „bazat pe profil” pentru a prezice structura secundară (adică, aranjamentele locale ale aminoacizilor) a proteinei. În a doua etapă, folosește un alt algoritm de învățare automată numit „bazat pe șablon” pentru a prezice structura terțiară (adică, forma generală 3D) a proteinei pe baza structurii secundare prezise.

ProAl poate fi utilizat pentru a prezice structurile de atât proteine solubile, cât și proteine membranare și a fost aplicată la o gamă largă de sisteme proteice, inclusiv enzime, receptori și proteine virale. Este un instrument util pentru cercetătorii care studiază funcția și dinamica proteinelor, precum și pentru descoperirea și dezvoltarea medicamentelor.