ProAl: мощное программное обеспечение для прогнозирования структуры белка

ProAl — это программное обеспечение для прогнозирования структуры белков, которое использует комбинацию алгоритмов машинного обучения и инструментов структурной биоинформатики для прогнозирования трехмерной структуры белков на основе их аминокислотной последовательности. Он был разработан Калифорнийским университетом в Сан-Диего и широко используется в области предсказания структуры белков.

ProAl использует двухэтапный подход к предсказанию структуры белка. На первом этапе он использует алгоритм машинного обучения, называемый «основанным на профилях», для прогнозирования вторичной структуры (т. е. локального расположения аминокислот) белка. На втором этапе он использует другой алгоритм машинного обучения, называемый «на основе шаблонов», для прогнозирования третичной структуры (т.е. общей трехмерной формы) белка на основе предсказанной вторичной структуры.

ProAl можно использовать для прогнозирования структур как растворимые, так и мембранные белки, и его применяли к широкому спектру белковых систем, включая ферменты, рецепторы и вирусные белки. Это полезный инструмент для исследователей, изучающих функции и динамику белков, а также для открытия и разработки лекарств.