Proteomik Araştırmalarında Kütle Spektrometresi Eşiğinin (MS-Th) Gücünün Kilidini Açmak

MS-TH, "Kütle Spektrometresi - Eşik" anlamına gelir.

Kütle spektrometrisinde eşik enerjisi (veya eşik), bir molekülü iyonize etmek ve kütle spektrometresi tarafından tespit edilebilecek iyonları üretmek için gereken minimum enerji miktarını ifade eder. Eşik enerjisi tipik olarak cihazın ayarları tarafından belirlenir ve cihazın türüne ve analiz edilen numuneye bağlı olarak değişebilir.

MS-Th bağlamında, kütle spektrometresi bazlı proteomiklerin hassasiyetini ve doğruluğunu artırmak için kullanılan bir tekniktir deneyler. MS-Th'nin arkasındaki temel fikir, daha fazla miktarda bulunan peptidleri tespit etmek için daha düşük bir eşik enerjisi kullanırken, daha az miktarda bulunan peptidleri tespit etmek için daha yüksek bir eşik enerjisi kullanmaktır. Bu, en çok bulunan peptidlerin daha az bulunanlardan ayrılmasına olanak tanır, bu da verilerin genel kalitesini artırabilir ve karmaşık karışımlardaki proteinlerin tanımlanmasını kolaylaştırabilir.

MS-Th tipik olarak cihaz ayarlarının bir kombinasyonu kullanılarak elde edilir. farklı peptit popülasyonlarının tespitini optimize etmek için iyon kaynağı parametrelerinin, kütle analiz cihazı parametrelerinin ve dedektör kazancının ayarlanması gibi. Kullanılan spesifik ayarlar deneye ve analizin hedeflerine bağlı olacaktır ancak genel fikir, en bol bulunan peptidler için daha düşük bir eşik enerjisi ve daha az bulunan peptidler için daha yüksek bir eşik enerjisi kullanmaktır.