ProAl: потужне програмне забезпечення для прогнозування структури білка

ProAl — це програмне забезпечення для прогнозування структури білків, яке використовує комбінацію алгоритмів машинного навчання та інструментів структурної біоінформатики для прогнозування тривимірної структури білків на основі їх амінокислотної послідовності. Він був розроблений Університетом Каліфорнії в Сан-Дієго та широко використовується в галузі прогнозування структури білка.

ProAl використовує двоетапний підхід до прогнозування структури білка. На першому етапі він використовує алгоритм машинного навчання, який називається «на основі профілю», щоб передбачити вторинну структуру (тобто локальне розміщення амінокислот) білка. На другому етапі він використовує інший алгоритм машинного навчання, який називається «на основі шаблону», щоб передбачити третинну структуру (тобто загальну тривимірну форму) білка на основі прогнозованої вторинної структури.

ProAl можна використовувати для прогнозування структур як розчинних, так і мембранних білків, і його було застосовано до широкого спектру білкових систем, включаючи ферменти, рецептори та вірусні білки. Це корисний інструмент для дослідників, які вивчають функцію та динаміку білків, а також для відкриття та розробки ліків.