Massaspektrometrian kynnyksen (MS-Th) tehon vapauttaminen proteomiikkatutkimuksessa

MS-TH on lyhenne sanoista "massaspektrometria - kynnys". Massaspektrometriassa kynnysenergia (tai kynnys) viittaa vähimmäisenergiamäärään, joka tarvitaan molekyylin ionisoimiseen ja ionien tuottamiseen, jotka voidaan havaita massaspektrometrillä. Kynnysenergia määräytyy tyypillisesti laitteen asetusten mukaan, ja se voi vaihdella instrumentin tyypin ja analysoitavan näytteen mukaan.

MS-Th:n yhteydessä se on tekniikka, jota käytetään parantamaan massaspektrometriaan perustuvan proteomiikan herkkyyttä ja tarkkuutta. kokeiluja. MS-Th:n perusideana on käyttää matalampaa kynnysenergiaa runsaampien peptidien havaitsemiseen, kun taas korkeampaa kynnysenergiaa vähemmän runsaiden peptidien havaitsemiseen. Tämä mahdollistaa runsaimpien peptidien erottamisen vähemmän esiintyvistä, mikä voi parantaa tietojen yleistä laatua ja helpottaa proteiinien tunnistamista monimutkaisissa seoksissa.

MS-Th saavutetaan tyypillisesti käyttämällä laiteasetusten yhdistelmää, kuten ionilähdeparametrien, massa-analysaattorin parametrien ja ilmaisimen vahvistuksen säätäminen eri peptidipopulaatioiden havaitsemisen optimoimiseksi. Käytettävät erityiset asetukset riippuvat kokeesta ja analyysin tavoitteista, mutta yleinen idea on käyttää matalampaa kynnysenergiaa runsaimmille peptideille ja korkeampaa kynnysenergiaa vähemmän runsaille.