ProAl: un potente software di previsione della struttura delle proteine

ProAl è un software di previsione della struttura delle proteine che utilizza una combinazione di algoritmi di apprendimento automatico e strumenti di bioinformatica strutturale per prevedere la struttura tridimensionale delle proteine dalla loro sequenza di aminoacidi. È stato sviluppato dall'Università della California, a San Diego ed è ampiamente utilizzato nel campo della previsione della struttura delle proteine.

ProAl utilizza un approccio in due fasi per la previsione della struttura delle proteine. Nella prima fase, utilizza un algoritmo di apprendimento automatico chiamato “basato sul profilo” per prevedere la struttura secondaria (cioè la disposizione locale degli amminoacidi) della proteina. Nella seconda fase, utilizza un diverso algoritmo di apprendimento automatico chiamato "basato su modello" per prevedere la struttura terziaria (ovvero la forma 3D complessiva) della proteina in base alla struttura secondaria prevista.

ProAl può essere utilizzato per prevedere le strutture di sia alle proteine solubili che a quelle di membrana, ed è stato applicato a un'ampia gamma di sistemi proteici, inclusi enzimi, recettori e proteine virali. È uno strumento utile per i ricercatori che studiano la funzione e la dinamica delle proteine, nonché per la scoperta e lo sviluppo di farmaci.