ПроАл: Моћан софтвер за предвиђање структуре протеина

ПроАл је софтвер за предвиђање структуре протеина који користи комбинацију алгоритама машинског учења и структурних биоинформатичких алата за предвиђање тродимензионалне структуре протеина из њихове аминокиселинске секвенце. Развио га је Универзитет Калифорније у Сан Дијегу и широко се користи у области предвиђања структуре протеина.ӕӕПроАл користи двостепени приступ предвиђању структуре протеина. У првој фази, користи алгоритам машинског учења назван „засновано на профилу“ да би предвидео секундарну структуру (тј. локални распоред аминокиселина) протеина. У другој фази, користи другачији алгоритам за машинско учење назван „засновано на шаблону“ за предвиђање терцијарне структуре (тј. укупног 3Д облика) протеина на основу предвиђене секундарне структуре.ӕӕПроАл се може користити за предвиђање структура како растворљиве тако и мембранске протеине, а примењен је на широк спектар протеинских система, укључујући ензиме, рецепторе и вирусне протеине. То је користан алат за истраживаче који проучавају функцију и динамику протеина, као и за откривање и развој лекова.