ProAl: Phần mềm dự đoán cấu trúc protein mạnh mẽ

ProAl là phần mềm dự đoán cấu trúc protein sử dụng kết hợp các thuật toán học máy và các công cụ tin sinh học cấu trúc để dự đoán cấu trúc ba chiều của protein từ chuỗi axit amin của chúng. Nó được phát triển bởi Đại học California, San Diego và được sử dụng rộng rãi trong lĩnh vực dự đoán cấu trúc protein.

ProAl sử dụng phương pháp tiếp cận hai giai đoạn để dự đoán cấu trúc protein. Ở giai đoạn đầu tiên, nó sử dụng thuật toán học máy được gọi là "dựa trên hồ sơ" để dự đoán cấu trúc thứ cấp (tức là sự sắp xếp cục bộ của các axit amin) của protein. Ở giai đoạn thứ hai, nó sử dụng một thuật toán học máy khác gọi là "dựa trên mẫu" để dự đoán cấu trúc bậc ba (tức là hình dạng 3D tổng thể) của protein dựa trên cấu trúc bậc hai được dự đoán.

ProAl có thể được sử dụng để dự đoán cấu trúc của cả protein hòa tan và protein màng, và nó đã được áp dụng cho nhiều hệ thống protein, bao gồm enzyme, thụ thể và protein virut. Nó là một công cụ hữu ích cho các nhà nghiên cứu nghiên cứu chức năng và động lực học của protein, cũng như để khám phá và phát triển thuốc.